A primeira "obra" da Comunidade de Sant'Egidio é a oração. Foi justamente a partir do encontro com as Escrituras, postas no meio da vida, é que nasceu uma proposta pessoal e comum, nova para aqueles jovens do ano '68 que estavam à procura de uma vida mais autêntica: é o antigo convite que Jesus dirige a cada geração, o de serem seus discípulos. É o convite a converter-se, deixando de viver só para si mesmo e a começar a ser, com liberdade, instrumento de um amor maior para todos, homens e mulheres e, antes de mais, para com os pobres. Escutar e viver a Palava de Deus como a coisa mais importante da nossa vida quer dizer aceitar seguirmos não a nós mesmos mas sim ao Senhor. A imagem mais autêntica é a da Comunidade durante a oração, quando está reunida para escutar a Palava de Deus. É como a família dos discípulos reunida em redor de Jesus. Concórdia e assiduidade na oração (Ac.2,42) são o caminho simples, oferecido e pedido a todos os membros da Comunidade. A oração é um caminho ao longo do qual nos familiarizamos com as palavras de Jesus e com a sua oração, com a das gerações que nos precederam, como nos Salmos, enquanto levamos ao Senhor as nossas necessidades e as dos pobres e as do mundo inteiro.

E' por isso que as comunidades, em Roma e em muitas partes da Itália, da Europa e do Mundo, se reunem o mais frequentemente possível para rezarem juntas. Em muitas cidades, todas as noites, há uma oração comunitária aberta a todos. A cada membro da Comunidade também se pede para que encontre um espaço significativo na própria vida para a oração pessoal e para a leitura das Escrituras, começando pelos Evangelhos.